PRZEBIEG MISJISonda wystartowała dnia 7 kwietnia 2001r o godz. 15:02:22 UTC za pomocą rakiety Delta 2. Miejscem startu był przylądek Canaveral. Na krótki czas sonda została umieszczona na parkingowej orbicie okołoziemskiej nachylonej w stosunku do równika o 52°, nietypowej dla misji międzyplanetarnej. Za pomocą trzeciego stopnia rakiety nośnej pojazd został skierowany na trajektorię okołosłoneczną przecinająca orbitę Marsa. Start był na tyle precyzyjny że zrezygnowano z pierwszej korekty kursu. Podczas lotu międzyplanetarnego przeprowadzono cztery korekty: 23.05.2001r, 02.07.2001r, 17.09.2001r i 23.10.2001r. 12 dni po starcie próbnik przesłał pierwsze kalibracyjne obrazy Ziemi z odległości 3 mln kilometrów. Następnie sonda brała udział w badaniach błysków gamma. Detektory neutronów o wysokiej energii wykrywały rozbłyski między 8 a 17 maja 2001r. Porównanie wyników z pomiarami innych sond i satelitów pozwoliło na określenie kierunku, z którego docierała największa ilość wysokoenergetycznych cząstek. Lot na Marsa przebiegał bez większych problemów, oprócz kłopotów z zabłąkanym światłem rejestrowanym przez szperacz gwiazd.
Start misji 2001 Mars Odyssey z przylądka Canaveral nagrany amatorską kamerą:
Sonda osiągnęła orbitę Marsa dnia 23.10.2001r o godz. 02:26 UT poprzez odpalenie silnika rakietowego na 19.7 minut. Próbnik przebył trasę 460 mln kilometrów. Obieg po silnie eliptycznej orbicie początkowej trwał 18.6 godzin. Wkrótce po osiągnięciu celu rozpoczęto hamowanie atmosferyczne polegające na przelotach przez górną atmosferę Marsa na wysokość 110 km ponad powierzchnią. Umożliwiło to wyhamowanie i zmniejszenie promienia orbity. Operacja trwała 76 dni, i została zakończona po 332 obiegach dn. 14 stycznia 2002r. Orbita przebiegała wtedy na wysokości od 201 do 500 kilometrów ponad planetą. Następnie trajektoria została ukołowiona, tak, że przebiegała na wysokości 400 km ponad biegunami Marsa. Proces ten zakończono 30 stycznia 2002r. Program naukowy rozpoczęto w lutym 2002 roku. Misja nominalna trwała 917 dni i zakończyła się w lutym 2004. Potem do października 2005r sonda realizowała misje rozszerzoną i zajmowała się obieraniem danych z łazików MER. Później misja była przedłużana.
GRS został uruchomiony 19 lutego 2002r. Wysięgnik był w tedy złożony. Wstępne rezultaty pomiarów wykazały, że pod powierzchnią, w okolicach południowego bieguna Marsa, mogą znajdować się znaczne ilości lodu wodnego. Na podstawie dalszych, znacznie dokładniejszych obserwacji dokonanych po rozwinięciu wysięgnika (04.06.2002) można było określić, że powyżej 60 st na obu półkulach zawartość lodu w warstwie gleby o grubości 1 metra może wynosić aż 50%.
Przyrząd MARIE nie funkcjonował od sierpnia 2001 r. Był on jednak spowodowany błędem programowania i instrument został uruchomiony 7 marca 2002 roku. Instrument pozwolił na stwierdzenie, że podczas lotu międzyplanetarnego astronauci przyjmowaliby dzienne dawki promieniowania na poziomie 2 miliradów. na powierzchni Marsa dawka ta byłaby mniejsza o połowę. Łącznie z promieniowaniem podczas rozbłysków słonecznych dawka promieniowania jaką otrzymałaby załoga podczas 3-letniej mieściłaby się przyjmowanych przez NASA normach. 28 października 2003r, instrument przestał działać podczas wzmożonej aktywności słonecznej. Jego program naukowy zakończył się jednak powodzeniem
THEMIS dostarczył pierwszy, podczerwony obraz Marsa tuż po wejściu na orbitę. 2 listopada 2001r, podczas dalszej kalibracji uzyskano pierwsze obrazy optyczne. W marcu 2002r przyrząd uzyskał pierwsze w historii obrazy nocnej strony planety w podczerwieni. Podczas programu badawczego instrument potwierdził, iż warstwy skalne wykryte przez MGS różnią się składem mineralnym.
Misja 2001 Mars Odyssey dostarczyła i nadal dostarcza wielu bezcennych danych na temat Marsa. Sonda ta to ostatni orbiter z programu Mars Surveyor zawieszonego po utracie całości misji Surveyor 98 (obejmującej Mars Climate Orbiter, Mars Polar Lander i próbniki Deep Space 2). Pierwotnie projekt Surveyor 2001 obejmował - oprócz orbitera także lądownik, później przekształcony w misję Phoenix. Po katastrofie zmieniono podejście do problematyki badań Marsa tak, że orbitery i lądowniki były wysyłane w osobnych oknach startowych. Dawało to dłuższy czas na rozwiązanie przyczyn ewentualnych katastrof.
Załącznik 1 - Schemat trajektorii lotu międzyplanetarnego.
Załącznik 2 - Start sondy 2001 Mars Odyssey.
Załącznik 3 - Odyssey po starcie - obraz z RocketCam.
Załącznik 4 - Odyssey na orbicie Marsa - obraz z MGS.